بررسی نوترکیبی در بین جدایه‌های ویروس موزائیک سویا

عنوان دوره: بیست و یکمین کنگره گیاه پزشکی ایران

اکبر آهنگران؛ مینا کوهی حبیبی؛ غلامحسین مصاحبی محمدی؛ فرناندو گارسیا آرنال

ویروس موزائیک سویا (SMV) یکی از اعضاء جنس پوتی‌ویروس، به عنوان یکی از مهمترین بیماری‌های ویروسی سویا در تمامی مناطق کشت سویا در دنیا می‌باشد. در سال 1391 جدایه‌هایی از SMV، از مناطق مختلف استان‌های مازندران، گلستان، اردبیل و لرستان جداسازی گردید. ترادف کامل نوکلئوتیدی چهار جدایه ایرانی و ترادف نوکلئوتیدی نواحی ژنومی P1، P3، 6K1، CI و CP مربوط به 21 جدایه ایرانی دیگر تعیین گردید. رخدادهای نوترکیبی، جدایه‌های والد نوترکیب‌ها و نقاط شکست با استفاده از روش‌های RDP، GENECONV، Chimaera، MaxChi، BOOTSCAN و SISCAN در برنامه RDP4 شناسایی شدند. نوترکیبی بین جدایه‌های ایرانی SMV و 52 جدایه ویروس از سایر نقاط دنیا، که برای آنها ترادف کامل ژنومی در بانک ژن موجود بود، آنالیز شد. به این منظور، یا ترادف کامل ژنومی یا ترادف حاصل از اتصال قطعات ژنی کدکننده پروتئین‌های P1، P3، 6K1، CI و CP هر جدایه آنالیز شدند. آنالیز نوترکیبی نشان داد که ژنوم اکثر جدایه‌های گزارش شده (55 جدایه از 77 جدایه) دارای شواهدی از نوترکیبی می‌باشند. ورود جدایه‌های ایرانی در این آنالیز منجر به شناسایی سایت‌های نوترکیبی جدیدی در ژنوم SMV علاوه بر سایت‌های شناسایی شده توسط محققین قبلی گردید. همچنین نوترکیبی بین پاتوتیپ‌های مختلف ویروس شناسایی شد که نشان‌دهنده امکان آلودگی توام و همزمان سلول گیاه با پاتوتیپ‌های مختلف می‌باشد. در مجموع می‌توان گفت که نوترکیبی یکی از منابع مهم و موثر در تنوع ژنتیکی و تکامل SMV است.

ویروس موزائیک سویا؛ نوترکیبی؛ تکامل؛ تنوع ژنتیکی؛ پاتوتیپ