بررسی مولکولی جمعیتی از Pratylenchoides sp براساس ناحیه D2-D3 ژن 28S rDNA
عنوان دوره: بیست و دومین کنگره گیاهپزشکی ایران
نویسندگان
چکیده
نزدیکی رابطه جنس Winslow, 1958 Pratylenchoides با خانواده Merliniidae Siddiqi, 1971براساس برخی از خصوصیات ریخت‌شناسی مانند فاسمید، دایرید، سطوح جانبی و اعضای حسی سر برای اولین بار توسط ری‌یس (1993) مطرح شد. بعد از آن بررسی‌های بیشتر روی این جنس توسط اشتورهان (2011) انجام شد. وی نشان داد که این جنس تنها جنس دارای دایرید در خانواده Pratylenchidae است و در نهایت این جنس را در زیر خانواده Pratylenchoidinae در خانواده Merliniidae قرار داد. مطالعات مولکولی نیز قرار گرفتن این جنس دز خانواده Merliniidae را تایید می‌کند. در این بررسی، نمونهبرداری از بوتههای علفی ارتفاعات شهرستان رامسر (مازندران) انجام شد. پس از آن نمونه‌ها به آزمایشگاه منتقل، عملیات شستشو و. استخراج نماتدها انجام گرفت. در نمونه‌های مورد مطالعه، جمعیتی از جنس Pratylenchoides جمعآوری گردید. خصوصیات ریخت شناسی جمعیت مورد مطالعه عبارتند از: سر دارای 3 تا 4 حلقه، ناحیه لب‌ها متصل به بدن و شبکه کوتیکولی قوی و استایلت دارای گرههای گرد و تقریبا متمایل به انتهای بدن می‌باشد. غدد مری با روده هم‌پوشانی پشتی داشته و طول هم‌پوشانی بیش از 0.5 برابر عرض بدن در ناحیه مربوطه (0.5-1) می‌باشد. دو هسته تقریبا در یک موقعیت و در قسمت جلوی تقاطع مری و روده و هسته دیگر در انتها، اسپرماتکا گرد، اسپرم کروی تا نیمه کروی و سطوح جانبی با 6 شیار، دم به سمت انتهای بدن باریکتر شده و انتهای آن کروی تا نیمه کروی با شیارهای نامنظم است. به منظور شناسایی دقیق‌تر بررسی‌های مولکولی انجام شد. جمعیتی از گونه مورد مطالعه جداسازی و استخراج دیانای انجام گردید. پس از آن ناحیه ژنی 28S rDNA تکثیر و توالییابی شد. ناحیه تکثیر شده حدود 744 باز طول دارد. مقایسه توالی نمونه با اطلاعات بانک ژن (Nblast) نشان داد که جمعیت مورد مطالعه با گونه (KC843483) P. variabilis از ایران 96 درصد و با جمعیتی ازگونه (KC843487) crenicauda P. 95 درصد شباهت دارد. در درخت فیلوژنتیک رسم شده با روش Maximum likelihood جمعیت مورد بررسی با دیگر توالیهای موجود از گونه P. variabilis در یک گروه با بوتستراپ 92 درصد قرار گرفتند. جمعیت مورد مطالعه و سایر جمعیت های گونه P. variabilis با گونه P. crenicauda گروه خواهری تشکیل می‌دهد. همچنین در درخت فیلوژنی رسم شده وضعیت فیلوژنی جنس های خانواده Merliniidae نشان داده شده است. در پایه این درخت گونه‌های جنس Merlinius قرار گرفتند. نتایج نشان داد که جنس Amplimerlinius نزدیکترین جنس به Pratylenchoides می‌باشد. در درخت فیلوژنی گونه Psilenchus sp. به عنوان outgroup در نظر گرفته شده است. در این مطالعه همچنین فاصله ژنتیکی جمعیت مورد بررسی با سایر گونه‌های جنس Pratylenchoides بررسی شد. کمترین فاصله ژنتیکی با جمعیتهایی از P. variabilis (KC843486 و KC843485) از کشور ایران مشاهده شد. همچنین گونه مورد بررسی بیشترین فاصله ژنتیکی را با گونه P. magnicauda (KF026289) از ایران دارد.
کلیدواژه ها