بررسی مولکولی نماتد rigidus Panagrolaimus از کرمان براساس توالی یابی ناحیه 18S rDNA
عنوان دوره: بیست و یکمین کنگره گیاه پزشکی ایران
نویسندگان
چکیده
جنس Panagrolaimus Fuchs, 1930 جزء نماتدهای باکتری خوار می باشد که در زیستگاه های مختلف یافت می شود. حین بررسی نماتودهای خاکزی جمعیتی از این جنس جداسازی گردید که با توجه به مقایسات مورفولوژیکی گونه آن P. Rigidus تشخیص داده شد. جهت انجام مطالعات مولکولی ناحیه ژنی 18S rDNA تکثیر و توالی یابی گردید. ناحیه تکثیر شده حدود 912 باز طول دارد. مقایسه توالی نمونه با اطلاعات بانک ژن (Nblast) نشان داد که جمعیت مورد مطالعه با گونهP. papillosus (KF011489) از ایران 92 درصد و با گونه (DQ285636) P. rigidus از کشور بلژیک 87 درصد شباهت دارد. در آنالیز فیلوژنتیک با روش Neighbor Joining این گونه به همراه گونه P. papillosus از ایران در یک شاخه با ارزش بوتستراپ 96 قرار گرفتند. هر چند اغلب گونه های این جنس در آنالیز فیلوژنتیک کنار هم و در یک گروه قرار گرفتند اما نتایج بر اساس داده های موجود در بانک ژن (GenBank) نشان می دهد که این جنس مونوفیلتیک نمی باشد.
کلیدواژه ها