آنالیزمولکولی و توالی یابی گونه Xiphinema index از خراسان جنوبی و موقعیت فیلوژنتیکی آن بر اساس دامنه D2-D3 ژن 28SrDNA
عنوان دوره: بیست و یکمین کنگره گیاه پزشکی ایران
نویسندگان
چکیده
نماتود Xiphinema index در حین نمونه برداری از شهرستان بیرجند در استان خراسان جنوبی جداسازی گردید. بر اساس ویژگی های مرفولوژیک جمعیت مورد نظر شناسایی گردید و به منظور مطالعات دقیق تر، قطعه D2-D3 ناحیه ژنی 28SrDNA با استفاده از پرایمرهای اختصاصی تکثیر و توالی یابی شد. مقایسه توالی نمونه با اطلاعات بانک ژن (Nblast) نشان داد که جمعیت مورد مطالعه با جمعیت هایی از گونه X. index از کشور اسپانیا (HM921348) و آرژانتین (AY601628) در یک کلاد با 100 درصد شباهت قرار می گیرند. در آنالیز فیلوژنتیک به روش Maximum parsimony و Neighbor joining، این جدایه به همراه گونه های کشورهای اسپانیا و آرژانتین در یک شاخه (کلاد) با ارزش بوتستراپ 100درصد قرار گرفت. در این تحقیق موقعیت فیلوژنی این گونه از ایران با سایر نماتدهای هم گروه مورد بررسی قرار گرفت. ناحیه D2-D3 ژن 28SrDNA از گونه X. index برای اولین بار از خراسان جنوبی گزارش می گردد.
کلیدواژه ها