موقعیت فیلوژنتیکی گونه Tylenchorhynchus dubius جمع آوری شده از ریزوسفر شلغم شهرستان بافت (کرمان) بر اساس توالی 28srDNA
عنوان دوره: بیست و یکمین کنگره گیاه پزشکی ایران
نویسندگان
چکیده
جنس Tylenchorhynchus یکی از نماتودهای خانواده Belonolaimidae می باشد که در جمعیت بالا می تواند موجب خسارت در محصولات باغی و زراعی شود. در حین نمونه برداری از خاک های مزارع شلغم (Brassica rapa L) منطقه بافت در استان کرمان گونه ای از جنس Tylenchorhynchus جداسازی گردید که بر اساس کلیدها و شرح های موجود T.dubius شناسایی شد. به منظور شناسایی دقیق تر و تعیین موقعیت فیلوژنتیکی این جمعیت، قطعه D2D3 ناحیه ژنی 28S rDNA با استفاده از پرایمر های اختصاصی تکثیر و توالی یابی شد. نتایج آنالیز فیلوژنتیکی با استفاده از روش Neighbor Joining و نرم افزار مگا 5 نشان داد که جمعیت مورد مطالعه با جمعیت هایی از همین گونه از کشور امریکا (EU368590; DQ328707 ) با ارزش بوتستراپ 100 در یک شاخه قرار می گیرند. بررسی فاصله ژنتیکی نشان داد که جمعیت مطالعه شده بیشترین فاصله ژنتیکی با گونه T. claytoni (140/0) و کمترین فاصله ژنتیکی با جمعیت های T. dubius (030/0) دارد. میزان G+C گونه مطالعه شده (3/57) در مقایسه با سایر جمعیت مطالعه از همین گونه در آنالیز فیلوژنتیکی بالاتر می باشد.
کلیدواژه ها