شناسایی مولکولی و تجزیه و تحلیل فیلوژنتیک جدایه های Pseudoperonospora cubensis از مالزی

عنوان دوره: بیست و یکمین کنگره گیاه پزشکی ایران

سیزده جدا شده از cubensis Pseudoperonospora، عامل سفیدک دروغین کدوئیان از مزارع جالیز بخش غربی شبه جزیره مالزی در طول فصل رویشی بین نوامبر 2008 و مارس 2009 جمع آوری شد. دامنه میزبانی این جدایه ها قبلا با استفاده از روش دیسک برگ (Leaf Disc) تعیین شده بود و نتایج نشان داد که 12 پاتیوتایپ در میان این نمونه ها وجود دارد. هدف از این مطالعه، بررسی روابط فیلوژنتیک موجود در بین این جدایه ها با استفاده از روش مقایشه توالی ناحیه ژنی ریبوزومی (ITS) DNA و ناحیه ژنی COX-II از میتوکندری بوده است. نتایج نشان دادند که تشابه بالایی در بین توالی ژنی این نمونه ها وجود دارد بطوری که در ناحیه ITS بیش از 99درصد و برای ناحیه COX-II بالای 98 درصد با نمونه های ثبت شده در بانک جهانی همخوانی ردیابی گردید. تجزیه و تحلیل فیلوژنتیک بر اساس روش Minimum Evolution در مناطق ITS و COX-II انجام و در نتیجه در این دو ناحیه پنج و سه گروه به ترتیب مشاهده گردید. در این تحقیق، رابطه ای بین گروه بندی فیلوژنتیک با استفاده از این دو ناحیه ژنی و نوع پاتوتایپ شناسایی شده در بین جدایه ها پیدا نگردید.

پاتوتایپ؛ تنوع ژنتیکی؛ سفیدک درخین؛ کدوئیان